Rapide et précis
Très adaptable
Exhaustif
Disponible
Qu’est-ce que le séquençage ciblé de nouvelle génération, et comment est-il utilisé en santé mondiale ?
Le séquençage ciblé de nouvelle génération est une technologie de diagnostic recommandée par l’Organisation mondiale de la Santé (OMS) qui permet d’analyser des sections ciblées du génome d’une bactérie ou d’un virus. En santé mondiale, cette technologie permet d’identifier rapidement plusieurs maladies. Elle est particulièrement utile pour le dépistage de la tuberculose, une maladie causée par un agent pathogène qui présente des taux élevés de mutations génétiques pouvant rendre les schémas thérapeutiques inefficaces. Comme elle détecte rapidement les profils de résistance, elle fournit aux prestataires de soins de santé de précieuses informations leur permettant d’adapter le traitement. Le séquençage ciblé de nouvelle génération a des applications qui dépassent le diagnostic de la tuberculose.
C’est un outil qui peut détecter différents agents pathogènes, comme le VIH et les virus causant les hépatites et le COVID-19, et caractériser leur sensibilité aux médicaments. La pandémie de COVID-19 a catalysé l’adoption des plateformes de séquençage. Aujourd’hui, l’équipement nécessaire pour le séquençage ciblé de nouvelle génération est beaucoup plus courant qu’avant la pandémie, en particulier dans les pays à revenu faible ou intermédiaire.
Comment le séquençage ciblé de nouvelle génération se compare-t-il aux autres méthodes de dépistage de la tuberculose ?
La tuberculose est une maladie très complexe dont le traitement nécessite la combinaison de plusieurs antibiotiques, et la résistance à ces médicaments est de plus en plus fréquente. C’est pourquoi le personnel de santé doit disposer de moyens lui permettant de savoir quels médicaments seront les plus efficaces. Avec le séquençage ciblé de nouvelle génération, le personnel de santé peut établir le profil complet de pharmacorésistance des médicaments de première et de deuxième intention contre la tuberculose, et ainsi offrir des traitements mieux adaptés. Fait important à noter, il s’agit de la seule méthode de diagnostic pouvant identifier rapidement la résistance à la bédaquiline, un médicament clé utilisé dans les nouveaux traitements courts de la tuberculose pharmacorésistante.
Bien qu’il ne soit pas la méthode de diagnostic la plus rapide, le séquençage ciblé de nouvelle génération est néanmoins plus rapide que la plupart des autres et, surtout, beaucoup plus sensible et adaptable. Il est possible de mettre à jour régulièrement les plateformes de séquençage pour suivre l’évolution des profils de mutations, un aspect important pour garder une longueur d’avance sur la pharmacorésistance.
Comment Unitaid accélère-t-elle l’accès au séquençage ciblé de nouvelle génération pour le diagnostic de la tuberculose ?
Dans le cadre de notre projet conjoint avec FIND, Seq&Treat, nous avons démontré que le séquençage ciblé de nouvelle génération pouvait servir à tester la résistance aux médicaments contre la tuberculose. L’OMS s’est fondée sur les résultats de ces travaux pour recommander un usage élargi de cette technologie. L’équipe du projet Seq&Treat a mis sur pied un portail de séquençage pour la tuberculose, dans lequel sont cumulées les connaissances sur l’association entre les mutations génétiques et la résistance aux médicaments. Le portail met à la disposition des pays les données les plus récentes sur la résistance aux médicaments contre la tuberculose et permet d’ajouter rapidement les profils de résistance émergents aux plateformes de séquençage.
Bien que les plateformes de séquençage ciblé de nouvelle génération soient coûteuses et complexes, leur grande utilité pour l’identification et le suivi du COVID-19 a catalysé leur adoption dans le monde entier. Aujourd’hui, les pays à revenu faible ou intermédiaire tirent parti de ces infrastructures de pointe pour la riposte à la tuberculose.
